La película empieza con un recordatorio del mundo Pokémon, en la que se nos explica de que trata el mundo Pokémon. En esta escena aparece primero Ho-oh surcando los cielos, un Mewtwo solitario en la ciudad, Lugia saliendo de las profundidades del mar bajo la luz de la luna, de un volcán en erupción Entei. Más tarde aparece Celebi en el bosque y Latias y Latios recorriendo los canales de Altomare. Continuando con la explicación del mundo Pokémon, aparece Bruno y el personaje de Bella en una batalla doble con Pokémon de Hoenn, en la que se enfrentan Shiftry y Aggron contra Manectric y Solrock.
Antes de que empiece la película, nos explican la historia y los propósitos del Team Magma de hacer renacer a Groudon mientras se nos muestra al Team Magma en su cuartel general viendo un video de Groudon. Es aquí cuando un científico del Team Magma, Butler, junto a Dianne, están metidos en sus investigaciones, encuentra en una de sus excavaciones algo interesante, un meteorito de cristal y de color lila.
En otro cambio de escena, se nos introduce a los protagonistas de la historia, Ash, Brock, Aura y Max, y nos explican de forma breve las aventuras de Ash en la región de Hoenn y como capturó a sus Pokémon. Primero aparece la escena en la que Pikachu y Swallow se enfrentaron y luego otra en la que aparece junto a todos sus Pokémon de Hoenn. Finalmente, el narrador finaliza la introducción diciendo que este es el inicio de la historia que protagonizarán nuestros héroes y el Pokémon legendario Jirachi.
La introducción de la película continúa con su tónica habitual. Con una animación 3D hecha por ordenador, aparece el logotipo de "Pokémon Advanced Generation" entre rayos de luz, y una vez formado el logotipo cambia el fondo y aparece el título de la película "Nana-Yo no Negai Boshi Jiraachi" como si estuviera dentro del cristal lila ya mencionado. Luego el logo de la película se precipita sobre la cámara y empieza la historia...
Un día antes de que la estrella de los deseos llegue a verse, empieza la historia. Todo empieza en una noche clara y estrellada en el que Ash y sus amigos están caminando a través de una ladera con hierba. Aura se queja y pregunta cuando piensan parar para acampar, pero Brock ya había planeado antes. Se trata de acampar en una ladera cercana al parque de atracciones. Ash, que está emocionado corre hacia la ladera, y luego Aura, Max y finalmente Brock. Corren hacia esa ladera, pero cuando miran, no ven el parque de atracciones. Brock y Aura comprueban en el mapa si es el lugar correcto y deciden pasar la noche ahí puesto que han llegado un día antes de lo previsto.
Esa misma noche, empiezan a llegar camiones de grandes dimensiones a la zona, trayendo las norias, tiendas, globos, etc. Pikachu les escucha llegar y rápidamente despierta a Ash. Los demás se despiertan también puesto que están haciendo bastante ruido. ¡Ha llegado el parque de atracciones! Ash y compañía ven como empiezan a montar el parque de atracciones mientras empieza a sonar la música de introducción y aparecen los créditos. Los camiones empiezan a abrirse y empiezan a aparecer globos Pokémon, como el de Wailmer, y se empiezan a montar las tiendas y los coches de choques. Luego dos camiones se paran en un área más apartada y con más espacio. De uno de esos camiones se baja un mago, y del otro su ayudante. El mago saca su barita mágica y una bola detrás de otra aparecen de su barita botando todas en una misma dirección. La ayudante, con un gran abanico empieza a desviarlas a la izquierda y a la derecha y las colocan de forma que formen un círculo. Las bolas explotan y de ahí salen seis palos altos y como si de arte de magia se tratara empiezan a formar poco a poco la carpa donde el espectáculo más tarde se desarrollará. Se nos muestra una vista panorámica de toda la feria en la que ya hay de todo, noria, coches de coche, un montón de tiendas con juegos, muchos globos flotantes de Pokémon e incluso una montaña rusa. Al final, un tren aparece por el horizonte y está colocando las vías para los próximos trenes llenos de visitantes.
Día 1
El primer día de la estrella de los deseos ha llegado. Nuestros héroes aún no lo saben. Ash y compañía deciden pasar el día en el parque de atracciones pasándolo bien. En los coches de choque, Brock se distrae al volante por una chica bonita que le distrae y sufre un choque contra el límite de la pista. Mientras tanto, el Team Rocket que también está en el parque de atracciones ha conseguido trabajo como repartidores de panfletos del espectáculo de magia y van vestidos de payasos. Mientras están haciendo el payaso, ven a Ash y sus amigos que han recogido uno de los panfletos que anuncian el espectáculo de magia. En el panfleto dice que se celebra un gran espectáculo de magia, presentado por el "El Gran Butler". Les parece un espectáculo atractivo y deciden que es buena idea ir a verlo.
La carpa está llena de gente. Aparece Butler y convierte un pañuelo en su barita mágica. Un Mightyena sale con un sombrero puesto del cual sale un Kirlia.
Para el segundo truco, Butler pone a su Kirlia dentro de una caja, luego le pone un pañuelo encima y cuando lo levanta sale su asistenta de debajo de este. La asistenta está agarrando un cristal morado, y cuando lo levanta con ambas manos empieza a brillar. Todo el mundo se impresionó. Max escucha algo. Es una voz que parece llamarle desde dentro del cristal morado. Cuando la asistenta baja el cristal morado, Max continua escuchando la voz que le esta hablando y le dice que su nombre es Jirachi. Butler hace luego las presentaciones de sus ayudantes Pokémon Mightyena y Kirlia y de su asistenta Dianne.
Max sube al escenario sin pensarlo y Ash le sigue para tratar de pararlo, pero Max llega al escenario y les pregunta por qué el cristal morado le estaba hablando. Cuando Ash alcanza a Max le dice que baje del escenario, pero Max no le hace caso y continúa preguntando. Les explica que el cristal le ha dicho que se llama Jirachi. Butler decide improvisar un espectáculo de magia aprovechando que hay dos espectadores. Decide hacer un truco peligroso con ellos, en el que su Dusclops lanzará un Hiper Rayo contra una caja, donde Ash y Max deben meterse. La caja desaparecerá cuando Butler cuente a 10 y el Hiper Rayo sea lanzado. Salen dos payasos (James y Jessie) para demostrar al público que no tiene truco la caja donde se les ha colocado. Butler explica que ambos espectadores aparecerán en otro lado de la carpa cuando el Hiper Rayo alcance la caja. Brock y Aura están nerviosos. Butler empieza la cuenta atrás y Ash y max se ponen algo nerviosos. Max sigue pensado en Jirachi. Al llegar a 10 se lanza el Hiper Rayo y antes de que impacte contra Ash y Max la caja se hunde y les lleva a otro lado del escenario mediante un carril subterráneo. Mientras que todos creen que han desaparecido y miran al escenario Ash y Max salen por otro lado del escenario. Butler anuncia que han sido teletransportados sanos y salvos. Los focos enfocan donde Ash y Max están y el público empieza a aplaudir.
Pero cuando Ash y Max regresan al escenario de repente sale una mano metálica y coge a Pikachu. Es el Team Rocket, que se saca los trajes de payasos que llevaban y deciden capturar el Kirlia y el Mightyena de Butler. Empiezan la huida en un globo. Ash va a sacar uno de sus Pokémon para pararles pero Butler dice que se lo deje a él, que lo va a convertir en espectáculo. Butler llama a Dusclops y le dice que lance un ataque hacia el globo para quemar una de las cuerdas, que deja al Team Rocket colgando de un hilo literalmente. Eso libera a todos los Pokémon y luego Pikachu usa su ataque Rayo para hacerles despegar de nuevo.
Después del espectáculo, el grupo permanece para hablar de la misteriosa experiencia de Max. Dianne explica que el cristal contiene un Pokémon conocido como Jirachi, y se pega en el cristal, porque está durmiendo. Butler piensa que Jirachi ha escogido a Max, así que le dice que se puede quedar con el cristal y así poder hablar con Jirachi. Aura se opone, pero Dianne da el cristal a Max. Aura quiere ver el huevo de cristal más de cerca pero Max no le deja, apartándose de su hermana. Ambos entran al Parque de Atracciones y Ash y Brock les siguen.
Deciden pasearse por las tiendas del Parque. Aura se para en una de las tiendas, y se pone a mirar un amuleto. El vendedor dice que eso es "La Estrella de las 7 Noches". Le explica que, una vez cada mil años, una estrella fugaz pasa por la tierra solo durante 7 días. Si consigues ver la estrella fugaz, debes realizar un deseo y bajar una de las partes que componen "La Estrella de las 7 Noches", así cada día durante esas 7 noches para que se cumpla el deseo. Aura decide comprarlo. Justo después empiezan los fuegos artificiales en forma de Pokémon en el cielo. Max se lo enseña a Jirachi, intentando ser su amigo.
Esa noche el grupo decide dormir al raso, con un cielo que en un principio estaba nublado pero que se aclara y se ven las estrellas. Es un cielo precioso en el que se pueden ver las estrellas. También se puede percibir una aurora, pero las nubes no dejan ver que es. Al cabo de un poco la nube se aparta y descubren que es la Estrella de los Deseos. Aura recuerda lo que le dijo el vendedor, y pide el primer deseo. Después, mientras contemplan la estrella, empiezan a hablar de Jirachi y lo que Butler les había dicho. Se dan cuenta de que Max se ha quedado dormido. Entonces Aura le acaricia la cabeza, y Max responde diciendo "Mamá". Esas palabras recuerdan a Aura la canción de cuna que su madre siempre les cantaba y se pone a tararearla. De repente el cristal morado se pone a brillar intensamente despertando a Max. La energía de la tierra parece estar centrándose en el cristal. Pero Ash y compañía no son los únicos que se dan cuenta. Desde un lugar lejano, un Absol siente lo que está ocurriendo y decide dirigirse hacia ahí. El cristal flota en el aire y de él sale Jirachi. Max le mira mientras este flota en el aire y lentamente se despierta de su sueño milenario. Max le da la bienvenida a Jirachi y todos se presentan al Pokémon. Una vez esto, al no saber que hacer con Jirachi acuden a Butler.
Cuando llegan a la carpa de Butler, Dianne les pide que les esperen en el trailer. Max decide que Jirachi le enseñe de qué es capaz, así que decide pedirle un deseo. Aura, Ash y Brock empiezan a pelear para ver quien le pide el deseo a Jirachi, pero Max consigue a Jirachi. Puesto que Max es la pareja de Jirachi, él es quien pedirá el primer deseo. Max piensa y tras un rato de indecisión, decide pedir muchas golosinas. Jirachi trata de pensar que es y las tiras de la cabeza de Jirachi empiezan a brillar como señal de que el deseo se ha cumplido. Todos empiezan a mirar donde están, pero no las ven. De repente aparece una bolsa de patatas. Luego Jirachi empieza a volar y empieza a hacer aparecer muchas muchas golosinas, una detrás de otra. El problema es que esas golosinas no aparecen de la nada, sino que le están desapareciendo a un vendedor de la feria. El trailer se llena por completo de golosinas hasta que las puertas se abren y caen de dentro todos. Butler y Dianne van a mirar que ha ocurrido, pero ven que están bien, a pesar de estar algo confusos. Butler y Dianne se preguntan de donde han aparecido tantas golosinas. Ash dice que Jirachi las ha hecho aparecer. Butler menciona que había escuchado de camino que a un vendedor le estaba desapareciendo la mercancía, y entonces entienden lo ocurrido. Aura sale de debajo de todas las golosinas y coge una barra de chocolate y se la come, pero todos le dicen que pare. Max le pide a Jirachi que le devuelva al vendedor todas esas golosinas. Jirachi lo entiende mal y hace que Aura desaparezca. Por suerte, Aura aparece de nuevo arriba de todas las golosinas. Jirachi dice que tiene sueño y cae dormido. Jirachi se ha quedado sin energía y por eso se puso a dormir, le explica Butler. Luego Butler cambia el tema y dice que necesitará ayuda en su espectáculo ahora que James, Jessie y Meowth no están.
Absol llega al parque de atracciones al atardecer.
Día 2:
Al día siguiente, Ash y Brock se convierten en los nuevos ayudantes de Butler, y como no, van vestidos de payasos. Aura ayuda detrás del escenario, pero Max en cambio tiene el día libre para poder jugar con Jirachi. Se montan en varias atracciones: en un barco pirata, en unas tazas giratorias, etc. De mientras, Jessie, James y Meowth espían desde su globo en forma de Meowth. Comentan que si Jirachi puede hacer todos los deseos realidad, sin duda sería un buen Pokémon para Giovanni.
Max vuelve a la carpa de Butler tras su última actuación del día. Aura está moviendo detrás del escenario algunas cosas, pero se tropieza. Corre rápidamente para tratar de evitar que se le caiga lo que llevaba y luego Max aparece y le ayuda. Pero Jirachi habla a Max y le roba las gafas. Jirachi quiere jugar más y Max, como no ve sin gafas, tiene que perseguirle para recuperarlas. Entonces, Aura que no puede sostener más las cajas acaban por caer. Ash, Brock, Butler y Dianne vienen a comprobar que ha ocurrido. Aura explica que Jirachi ha distraído a Max y por eso las cajas han caído. De mientras, Max aún persigue a Jirachi, hasta que lo atrapa.
Entonces, Max nota que la carpa está rota por arriba. De golpe el espejo que tiene en frente se hace añicos. Es entonces cuando Max mira hacia el Pokémon que ha hecho eso. Es Absol. Max, corriendo, trata de escapar de Absol que le está persiguiendo y que quiere proteger a Jirachi. Max corre y corre hasta llegar al escenario.
Los demás llegan justo a tiempo, Aura envía a Torchic para enfrentar a Absol. Pero Torchic es demasiado débil hasta para hacerle un rasguño así que Pikachu se une a la batalla. Los ataques eléctricos funcionan, pero no lo suficiente para detenerlo. Jirachi no quiere que Pikachu y Torchic se lastimen y los teletransporta sobre de la carpa. ¡Absol decide atacar a Ash y compañía! Sin embargo, Butler parece tener siempre un truco bajo la manga y cuando Absol se acerca lo suficiente mueve un interruptor en su varita y una puerta trampa se abre. Ash y los demás se preguntan a donde fue Absol y entonces aparece en una jaula. Absol todavía está muy agitado por lo que Dusclops lo pone a dormir con Hipnosis. Todo está bien… por ahora.
Más tarde en la noche, en la carpa de Butler hay una compleja máquina y la parte superior de la carpa se encuentra abierta justo para que se vea la Estrella de los Deseos. Ahora lo único que le falta es a Jirachi. Por otro lado, Dianne no se le ve muy contenta y no encuentra que sea una buena idea lo que Butler quiere hacer.
Por esta noche, Ash y compañía duermen en la caravana de Butler, todos excepto Aura. Aura está fuera, con el amuleto, pidiendo un deseo por su segundo día. Tras pedir el deseo, Aura nota que Butler ha entrado y salido de la caravana con algo entre sus brazos.
Butler lleva cargando a Jirachi! Y por supuesto lo lleva a la máquina. Butler pone a Jirachi en una placa que hace levitar a Jirachi y lo que es peor, le causa mucho dolor. Absol también está despierto, tratando de romper la jaula. Dianne quiere que Butler se detenga, pero él no piensa detenerse. Lo que Butler quiere es que Jirachi extraiga la energía de la Estrella de los Deseos pero Jirachi se opone. Gracias a esto, Butler hace que Dusclops obligue a Jirachi a extraer la energía. Mientras tanto, Butler observa un pedazo de roca en una cápsula y recuerda aquel día con el Equipo Magma. Butler tenía la misma máquina y explicaba que la roca era la llave para invocar a Groudon. Una vez que la encendió, energía eléctrica fue dirigida hacia la roca y un cojín verde. Primero funcionó pero después la máquina comenzó a fallar y explotó. Necesitaba más energía y todo lo que consiguió Butler fueron risas del Equipo Magma. Pero pronto todo cambiaría.
Aura vuelve al trailer y despierta a todos para decirles que Jirachi no está. Sospechan que Butler lo tiene y se dirigen a la carpa. Es demasiado tarde para Jirachi y un “ojo” se abre sobre su estómago y un rayo se dispara directamente a la Estrella de los Deseos. Butler pone la roca en otro panel. Cuando el rayo llega a la Estrella de los Deseos, envía otro rayo de regreso a Jirachi. Sin embargo, la energía es demasiada para la máquina y explota. En ese instante Ash y los demás llegan al escenario. Butler y Dianne todavía están aturdidos por la explosión. Max saca a Jirachi de la máquina y empieza a huir. Dusclops detiene a Max con su ataque Psíquico pero Pikachu ataca al Pokémon fantasma para liberar a Max. Si Dianne no puede detener a Butler, entonces decide unirse a Ash y compañía y les ayuda a escapar junto con Jirachi. Justo en ese momento, Absol escapa de su jaula y mantiene ocupado a Butler por un rato.
Ash, Brock, Aura, Max, Jirachi y Dianne se suben al trailer y se van. Butler no los puede seguir así que envía a su Mightyena para que los siga. El grupo se pregunta a donde los va a llevar Dianne y ella les responde que los va a llevar al único lugar donde pueden ayudar a Jirachi. Mientras manejan, Mightyena planta un dispositivo localizador en el trailer. Dianne les explica a todos que Jirachi solo está despierto por siete días y luego vuelve a dormir por 1000 años… pero Jirachi tiene que estar en un cierto lugar. Por otra parte, Butler ve el localizador del trailer y se da cuenta a donde van. Presiona otro interruptor y se revela otra de sus máquinas… parece que lo único que quería era saber si Jirachi podía darle la energía suficiente para convocar a Groudon.
Día 3:
Al día siguiente, el día empieza con una escena graciosa en el que Dianne está conduciendo por un terreno con baches. Max, Jirachi y Aura están bien cogidos a unas barras que hay dentro del trailer para no caerse de su asiento. Pero Ash, que no tiene donde agarrarse, empieza a dar botes pequeños junto a su Pikachu y acaban cayendo al suelo. Aura, Max y Jirachi se ríen. Todo este movimiento y los baches causan que el localizador que el Mightyena había colocado se desprenda del parachoques del trailer.
Anochece, y el grupo debe acampar y Brock está cocinando la cena de esa noche. Después de cenar, Ash y Max y sus Pokémon se quedan dormidos, y Aura que sigue despierta pide a su amuleto el deseo por tercer día. Una vez pedido el deseo entra dentro del trailer, donde está Dianne. Tiene un cartel del Show Mágico de Butler en las manos. Aura le pregunta si ocurre algo y Dianne le explica que hubiera deseado que Butler no se comportara de ese modo. Le explica que Butler y ella son amigos desde niños y que siempre le ha deseado lo mejor. Dianne le explica que Butler, de niño, le encantaba hacer magia y que ensayaba y hacía magia para ella. Lo que ella desea es que sea un mago y que se olvide del Equipo Magma y de Groudon. Está convencida de que una vez que el cometa milenario haya pasado, sus ganas de resucitar a Groudon acabarán y volverá a ser el Butler que ella conoció.
Día 4:
Ash y sus amigos continúan en viaje en trailer a través de unas estrechas carreteras entre las montañas y un río. El Team Rocket los está siguiendo con el globo Meowth. Hacen una parada en el río, donde Ash y Max se ponen a jugar a lanzar piedras al agua y hacerlas rebotar. Ash tira su piedra primero y consigue que rebote dos veces su piedra. Luego tira Max y consigue que su piedra golpee el agua cuatro veces. Max gana a Ash en el juego y lo empieza a celebrar con Jirachi. Esa noche, el grupo para en un lugar montañoso, con altas montañas y un gran lago cerca. Aura se ha escondido detrás de una roca cercana al lago y está pidiendo su deseo al amuleto, pero Max la interrumpe y dice que no lo haga. Max sale corriendo hacia el lago y Ash le persigue y habla con el y le explica que el también ha tenido que dejar amigos atrás. Max le explica que el motivo de su enfado es que cada vez que ve a su hermana pidiendo el deseo al amuleto le recuerda que cada un día queda menos para estar con Jirachi, antes de que vuelva a su descanso milenario, y eso le pone triste.
Día 5:
Durante su viaje, el trailer se queda atrapado en el barro, y Ash y sus amigos deben bajar a empujarlo mientras Dianne trata de sacarlo de ahí desde el trailer. Al final consiguen sacarlo del barrizal donde había quedado atrapado y quedan salpicados de barro completamente. Todos se quedan con cara de sorpresa, y luego Jirachi se sacude el barro que lleva encima y todos empiezan a reír. Por la noche, Max se queja que no tiene suficiente tiempo para estar con Jirachi y recrimina a Aura que le haga ir a dormir tan pronto. Aura luego tatararea la canción de cuna que les cantaba su madre.
Día 6:
El trailer en el cual viajaban, finalmente se para en una colina. Todos salen del trailer y contemplan el verde paisaje. Han llegado a Faunz, donde el huevo de Jirachi fue encontrado. Empiezan a caminar por el bosque, poblado con numerosos Pokémon y se caracteriza por tener unas columnas de piedra dispersas por todo el bosque. Dianne dice que están muy cerca del lugar de retiro de Jirachi. Durante su camino aparecen varios Pokémon como son Altaria, Breloom, Linoone y Flygon. Cae la noche y deciden acampar en un escampado rodeado por montañas y rocas. Aura baja la siguiente pieza de su amuleto. Cuando acaban de cenar, Aura ordena a Max que se vaya a dormir, y Max se queja de que ese es el último día con Jirachi y le debería dejar más tiempo para jugar.
Día 7:
Durante el camino, el grupo se encuentra con Absol. Este les hace una seña de que lo sigan y ellos lo hacen. Les toma todo el día pero logran llegar a la cueva de donde Jirachi es originalmente. Y en muy poco tiempo llegan al lugar exacto. Hay un hoyo gigante en el techo de la cueva por el cual se puede ver claramente la Estrella de los Deseos. Jirachi empieza a volar hacia el cielo pero Max lo detiene. Max no quiere que Jirachi se vaya todavía pero Ash le pide que recuerde lo que hablaron hacía tres días. Max finalmente acepta el adiós y Jirachi flota hacia el cielo. Jirachi abre el ojo… pero antes que pueda disparar el rayo, ¡unas máquinas aparecen en el techo y atrapan a Celebi en una red de energía! Luego un pedazo del techo revela que es una cortina gigante que Butler había instalado para engañarlos. Las máquinas llevan a Jirachi hacia Butler donde tiene una versión mejorada de la máquina que había estado usando solo que esta vez está suspendida en el aire con cables. Pero parece que Ash y los demás no pueden hacer nada pues las máquinas están generando una barrera y todo lo que pueden hacer es ver el “show de Butler”.
Butler ajusta su máquina y tres interruptores emergen los cuales automáticamente se activan. Tres emisores puntiagudos surgen por debajo de la máquina. Butler pone la roca en su lugar. Jirachi no sabe lo que pasa, así que comoquiera dispara el rayo a la Estrella de los Deseos. La estrella dispara de vuelta y la máquina absorbe la energía. Butler mueve otro interruptor y los emisores disparan un rayo al suelo que dibuja la forma de Groudon. Casi está completo cuando Absol dispara un ataque de energía y hace explotar una de las máquinas. Absol sigue atacando y un Flygon llega también a ayudar y destruye otras dos. Parece que ellos dos llegaron justo a tiempo. Ash, Pikachu y Max se suben a Flygon para ayudar a Jirachi. Se dirigen rápidamente a la máquina pero no la pueden dañar pues podrían lastimar a Jirachi. Butler decide contraatacar con su Salamence en el cual el también se sube.
Salamence usa Lanza Llamas pero ninguno de sus ataques da en el blanco y esto le da a Ash un poco de tiempo para pensar. Ash sugiere que Max y Pikachu bajen a la plataforma y Ash y Flygon distraen a Butler hasta que Max pueda liberar a Jirachi. Flygon hace un aterrizaje rápido para dejar a Pikachu y Max. Pikachu destruye los generadores anti-gravedad que detenían a Jirachi y Max lo sujeta. Flygon regresa y todos se van volando una vez más… pero a Butler no parece importarle. Jirachi se despierta y se pone muy feliz al ver a Max. Pero parece que es muy tarde, el dibujo en el suelo ya empezó a invocar a Groudon. De debajo de la tierra Groudon emerge con líneas azueles que brillan a través de la tierra que lo cubre. Es una escena asombrosa pero una vez que Groudon está completamente fuera, Butler se da cuenta que algo no está bien. Lo primero que no está bien es que Groudon causa que la vegetación cerca de él muera… la segunda cosa era que tenía un patrón parecido a lava en su vientre. Este no es Groudon, ¡Es un monstruo! Los enormes pasos del monstruo causan que varios de los cables que suspenden la plataforma se rompan y la plataforma queda colgando de un hilo.
Para este momento, Brock, May, Dianne y Absol ya están afuera de la cueva y Flygon llega con ellos. Absol también se da cuenta que esto no está bien y trata de atacarlo. Pero a “Groudon” ni siquiera lo afecta un poco, y solo lo mira y entonces sus garras se convierten en unos tentáculos verdes que lo atrapan y consumen rápidamente. Después de esto, los picos a los lados de Groudon se convierten en tentáculos y persiguen a todos los Pokémon ahí presentes. Algunos tentáculos capturan a los Altaria, a Linoone y Breloom. ¡Un tentáculo también atrapa al Equipo Rocket! Butler y Salamence van con Ash y compañía. Como era de suponerse, es recibido con palabras de disgusto y odio pero el sabe ahora que ha cometido un grave error. El Groudon es una forma reencarnada de la energía de la Estrella de los Deseos. La única manera de detenerlo es revirtiendo el flujo de energía con la máquina. Todos están inseguros pero Jirachi accede a hacerlo con tal de ayudar a sus amigos.
Justo en ese momento, Groudon pone toda su atención en ellos y envía algunos tentáculos tras ellos. Brock y Aura son tragados mientras tratan de escapar. Otro tentáculo se dirige directamente a Butler pero Dianne se interpone y desaparece. Flygon, Ash y Max también son atrapados en un tentáculo, ¡pero Jirachi los teletransporta! (Una escena nos muestra a todos los que han sido absorbidos por Groudon y se ve que están atorados dentro de él) Sin embargo, tanto Ash como Butler están lejos de la plataforma y Groudon está demasiado cerca de ella como para acercarse. Sin embargo, en un plan de ahora o nunca, los dos se dirigen a la plataforma. Flygon evade los tentáculos de Groudon y Salamence logra escapar de ellos lanzándoles fuego. Butler se las arregla para llegar primero y empieza a preparar la máquina para que se encargue de Groudon. Butler toma la roca de su lugar pero los pasos gigantescos de Groudon hace que todo tiemble, ¡y se le resbala! Justo a tiempo Ash la atrapa y se acerca a la plataforma.
Ash, Max y Jirachi llegan a la plataforma mientras los dos dragones comienzan a mantener a Groudon ocupado. Jirachi se coloca en su lugar mientras que Ash, Max y Butler activan la máquina una vez más. Los dragones pronto son atrapados por Groudon. Los pisotones hacen que todos caigan pero Butler casi cae de la plataforma. Butler consigue mantenerse sobre la plataforma y todo lo que ahora están esperando Ash y Max es presionar el interruptor para activar la máquina. Groudon empieza su ataque hacia la plataforma. Como un acto final, Butler se pone delante de Ash, Max y Jirachi para que le traguen a él. Butler dice que es lo mínimo que él podía hacer tras causar este lío. Pero entonces Ash consigue presionar el interruptor.
La máquina lanza un rayo hacia la tierra y empieza a crear ondas de la luz. Esto interrumpe a Groudon y hace que caiga sobre la plataforma que está colgando que apenas se aguanta. Groudon se comienza a derretir. Está cubriendo ya la plataforma, a Ash y a Max... pero momentos antes que Groudon ahogase a ambos, Jirachi se levanta repentinamente entre sonrisas, creando un orbita de la luz. Entonces Jirachi vuela hacia arriba, empujando a Groudon hasta el cielo. Cuando Jirachi pasa justo por delante de su estrella, Groudon estalla, creando una lluvia de polvo. Todos los Pokémon se teletransportan repentinamente de nuevo a la tierra. Absol, Flygon y Salamence reaparecen también. Butler y Dianne son teletransportados a otra parte, después llegan Ash y compañía. Jirachi entonces viene abajo del brillo, como si fuera una estrella cayendo del cielo. Jirachi dice feliz que le gustan Max, Ash, Brock, y Aura. Y serán sus amigos para siempre. La cuadrilla expresa su amistad de nuevo a Jirachi. Pero ahora, es hora de que Jirachi duerma por 1000 años. Jirachi pregunta si pueden cantarle la canción de cuna para que pueda recordarles. Aura comienza cantar, entonces Ash, Brock, y Max se unen. Jirachi dice adiós mientras que el cristal comienza a crecer alrededor de él. La energía extraña que desprende Jirachi hace que su huevo se esconda bajo tierra, enterrando a Jirachi. Todos miran la escena y se despiden de Jirachi.
Día 8:
Butler decide retirarse del Equipo Magma y olvidarse de Groudon y simplemente desea ser un mago. Así pues, tomada la decisión, él y Dianne deciden emprender el camino hacia el parque de atracciones en su trailer. Ash recuerda a Aura sobre el amuleto que había comprado. Aura sorprendida mira lo busca rápidamente y cuando lo encuentra lo mira y decepcionada se da cuenta de que se ha olvidado de bajar el del último de día. A pesar de eso, Aura decide no darle más importancia y deciden emprender su camino de vuelta al parque de atracciones. Entonces, Max escucha una voz. Es la voz de Jirachi, que dice que no importa donde vaya o esté, siempre serán amigos.
Empieza a sonar la canción de clausura, Make a Wish (Pide un Deseo). Mientras que Ash y compañía están andando de vuelta al parque de atracciones, Aura se para y decide que no quiere andar más. Aura se empieza a quejar y lloriquea un poco. Entonces el señor que le vendió el amuleto, que pasaba por ahí cerca, decide recogerles y llevarles en camioneta.
Mientras suena la canción de clausura, vemos varias escenas. Aparecen nuestros héroes estirados en una ladera, observando al cielo. Parecen estar uniendo estrellas con los dedos e identificar así las constelaciones Pokémon. Hay un cambio de escena y ahora empiezan a aparecer varias constelaciones Pokémon, en las que aparecen un Teddiursa y Ursaring, un Machoke cogiendo un Seviper, un Kyogre, la mejilla de un Pikachu y Gligar.
Más tarde se les ve una vez más en el parque de atracciones, en el que hay fuegos artificiales Pokémon. Aparecen varios Pokémon como Pikachu, Pichu, Lotad, Torchic y Treecko. En otra escena de su viaje, se les ve en una colina, al lado del mar, en el que se les puede ver en bañador disfrutando con sus Pokémon. Finalmente, llegan a la cima de una montaña, desde la cual miran y finaliza la historia y también la canción.
